Itäinen syöpäkeskus on yksi viidestä alueellisesta syöpäkeskuksesta, jotka yhdessä koordinoivan yksikön kanssa muodostavat Kansallisen syöpäkeskuksen. Itäisen syöpäkeskuksen muodostavat Pohjois-Savon hyvinvointialue (PSHVA), Keski-Suomen hyvinvointialue (HYVAKS), Etelä-Savon hyvinvointialue (Eloisa) ja Pohjois-Karjalan hyvinvointialue (Siun sote) sekä Itä-Suomen yliopisto (UEF). 

Itäisen syöpäkeskuksen toimintaa johtaa johtoryhmä, jossa on edustettuna kaikki sopijapuolet. Johtoryhmä vastaa Itäisen syöpäkeskuksen strategisista linjauksista, huolehtii, että kunkin sopijapuolen yksiköt sitoutuvat toimintaan sekä valvoo päätösten ja velvoitteiden toteutumista.  Johtoryhmän puheenjohtajana toimii Outi Kuittinen (UEF) ja varapuheenjohtajana Heikki Miettinen (HYVAKS). 

Itäisen syöpäkeskuksen johtoryhmä

Pohjois-Savon hyvinvointialue: 

• Antti Hedman (varajäsen Sami Remes) 
• Päivi Auvinen (varajäsen Jan Seppälä)

Keski-Suomen hyvinvointialue: 

• Heikki Miettinen, varapuheenjohtaja (varajäsen Jan Böhm) 
• Heikki Hakkarainen (varajäsen Kyösti Tahkola) 

Itä-Suomen yliopisto: 

• Ville Leinonen (varajäsen Anna-Liisa Levonen-Harju) 
• Outi Kuittinen, puheenjohtaja (varajäsen Merja Heinäniemi) 

Siun Sote: 

• Liisa Sailas (varajäsen Jukka Heikkinen) 

Etelä-Savon hyvinvointialue: 

• Jaana Luukkonen (varajäsen Kimmo Kuosmanen)